非标记定量（Label free）蛋白质组学是重要的质谱定量方法，是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用同位素标签做样本标记，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-free定量蛋白质认为肽段在质谱中被检测的频率与其在样品中的含量成正相关，因此通过适当的算法，可以将肽段检测计数与蛋白质含量对应起来。本公司采用Thermo Fisher的Q Exactive HF质谱平台，结合Nano-LC，推出基于非标记定量Label-free定量蛋白质技术分析服务。

Label free蛋白组学项目流程

技术流程

 ①方案沟通确认→②样本提取→③蛋白质检→④酶切→⑤分级(基于凝胶或液相)→⑥质谱分析→⑦数据库比对→⑧生物信息学分析→⑨正式实验报告→⑩数据答疑

技术优势

●不受样本类型及样本数量限制；●费用低，无需昂贵的标记试剂；●操作简单，接近原始样品状态；

数据分析

①确定分析方案→②合格的质谱数据→③数据库比对→④确定蛋自质组成→定性蛋白质注释；GO注释；KEGG通路注释
①确定分析方案→②合格的质谱数据→③数据库比对→④确定蛋自质组成→⑤筛选差异蛋白→{其它组学关联分析；基因组关联分析；转录组关联分析；修饰组关联分析；代谢组关联分析；...}

①确定分析方案→②合格的质谱数据→③数据库比对→④确定蛋自质组成→⑤筛选差异蛋白→{Go富集分析；KEGG富集分析；聚类分析}